Het gehele kreekgebied heeft de bestemming natuurgebied en het oostelijk deel hiervan, 32 hectare, is eigendom van Het Zeeuwse Landschap. Bijna alle Zeeuwse kreeknatuurgebieden maken deel uit van het landbouwkundig gerichte afwateringssysteem van de omgeving. Een landbouw-peilbeheer is voor deze natuurgebieden ongunstig. Het Zeeuwse Landschap werkt samen met het Waterschap Zeeuws-Vlaanderen aan de gefaseerde verbetering van de waterkwaliteit en het grondwaterpeilbeheer van de Baarzandsche Kreek. Zo zorgen nieuwe sloten aan de rand van het natuurgebied er voor dat de kreek losgekoppeld kan worden van het landbouwgebied, is de kreek in zijn geheel uitgebaggerd, en zijn in het verleden opgehoogde graslanden en gedempte kreekvertakkingen weer uitgegraven.
De natuur van de Baarzandsche Kreek
De vegetatie van de lage, moerassige graslanden toont op een enkele plek een nog enigszins brak milieu, met soorten als zilte rus, moeraszoutgras en aardbeiklaver. De meeste moerasplanten duiden echter op een geheel zoet milieu. Kenmerkend hiervoor zijn bijvoorbeeld geknikte vossestaart, zomprus, pinksterbloem, moeraswalstro en watermunt. Van de weidevogels broeden hier onder andere kievit, tureluur, grutto, scholekster en slobeend. In de rietvegetatie broeden tientallen grauwe ganzen, en een enkel paartje van de grauwe kiekendief en grote karekiet. In voor- en najaar en 's winters verblijven er hier regelmatig tientallen tot honderden grauwe ganzen, kolganzen en smienten, en grote groepen trekkende weidevogels en steltlopers.
Toegankelijkheid
Het natuurgebied is niet vrij toegankelijk, maar het gebied is goed te overzien vanaf de Rijksweg N58 en, in mindere mate, vanaf de Schoondijkse weg en de Kruisdijkweg.